分子生物学当中的序列分析一直是生物学中的一大难题,那有没有什么软件可以帮助我们解决这个问题呢?这款
Geneious Prime 2021破解版就是一款非专业的分子生物学和序列分析软件,该软件可以提供生物学中最先进最全面的分子生物学序列分析服务。软件独有的梯形礼盒和峰值调用功能,可以帮助用户自动生成等位的基因列表,并且为了方便用户,可以更加轻松地阅读到列表中的数据,软件可以帮助用户在序列列表中显示出带有中文注释的基因组和特性汇编渲染图,那里可以更加轻松简单的获取到列表中的数据,以便于进行下一步的研究,除此之外,用户还可以在软件中模拟出分子克隆技术的相关操作,更加全面的独有算法,可以帮助你计算出实验过程中可能出现的任何问题,减少实验的失败率,以此来提高实验的效率。软件在全新的2021版本中进行了全面的优化和改良,该版本拥有着更加强大的功能加入,并且优化了软件的操作方法,现在整体操作,变得更加的简单易上手,同时,新的功能加入也让它变得更加全面。小编带来的是该软件的免激活破解版本,无需激活,直接安装破解即可免费使用,欢迎有需要的小伙伴到本站下载Geneious Prime 2021免激活版。
软件特色
一、桑格测序分析
1、简单的序列组装和容易的重叠群编辑,可提高定位精度并减少分析时间
2、用于基因预测,基序,翻译和变异调用的自动注释
3、具有自动梯形拟合和峰调用功能的基因型微卫星轨迹,并生成等位基因表
二、下一代测序分析
1、在高度可定制的序列视图中显示带注释的基因组和装配体的精美可视化效果
2、Geneious Prime 2021破解版强大的SNP变异分析,您可以选择算法或轻松查看提供的变异调用
3、无需任何统计编程语言R的专业知识即可进行简单的RNA-Seq表达分析
三、分子生物学
1、在一个步骤中模拟各种分子克隆操作,包括限制,Gateway,Golden Gate和In-Fusion克隆
2、使用优雅的引物设计工具设计和测试PCR和测序引物,并创建自己的可搜索引物数据库
3、强大的CRISPR工具可快速轻松地找到位点,设计指导RNA并分析您的编辑结果
四、NGS预处理,组装和制图
1、使用广泛的NGS预处理工具进行准确的下游分析,产生干净的序列数据
2、可靠的参考映射以及专有的映射算法可产生出色的结果
3、灵活的从头基因组组装可以使用比对工具进行比对和整理,处理来自所有测序仪的数据
五、比对和系统发育
1、使用包括MAFFT和Clustal Omega在内的可信赖算法对DNA或蛋白质进行成对和多重比对
2、使用经过同行评审的算法(包括RAxML和PAUP *)构建系统树,并调整可用于发布的图形的显示设置
六、NCBI和BLAST
1、在NCBI上快速搜索所有关键数据库以获取文献,DNA和蛋白质序列信息,或设置自动代理来进行搜索
2、BLAST搜索NCBI数据库中的序列,结果直接返回Geneious Prime 2021破解版,或建立本地数据库并在本地进行BLAST
3、将序列直接提交给GenBank,包括基因组,特征,引物痕迹等
Geneious Prime 2021破解版安装教程
1、首先从本站下载数据包然后解压,得到安装程序“_win64_with_jre.msi”
2、鼠标双击运行进入安装向导点击“next”进入下一步
3、选择第一项“I accept the terms of the license agreement”(我接受许可协议的条款),再点击“next”进入下一步
4、选择安装位置,默认路径为“C:Program Files”,建议最好不要安装到系统盘(C盘)
5、勾选“create a dessktop icon”(创建一个桌面图标)
6、软件安装需要一些时间请耐心等待即可
7、当安装完成后点击“finish”即可退出安装向导
8、安装完成后先不要运行,回到刚才下载的数据包中将破解补丁复制道软件的安装目录中替换原文件即可
9、破解完成,可以开始免费使用。
Geneious Prime使用教程
一、RNA/DNA二级结构折叠查看器
1、默认情况下,当选择寡序列中仅示出这个浏览器。如果要在非寡核苷酸序列上使用RNA折叠,请转到工具→首选项→外观和行为,然后启用显示所有序列上的显示DNA/RNA折叠视图选项。这将显示任何小于3000 bp序列的标签。如果选择的序列是DNA,则选项卡将标记为DNA Fold,如果是RNA,则将标记为RNA Fold
2、折叠预测由Vienna package RNAfold工具执行
使用“查看选项”,可以打开/打开和着色基础,翻转坐标,突出显示序列的开始(蓝色)和结束(红色)并旋转模型。与其他查看器一样,您可以放大模型并拖动视图,或者使用与序列查看器相同的键盘修改器使用滚轮。选择在序列视图和折叠视图之间同步。此外,在拆分视图模式下,折叠查看器在放大时将滚动到所选区域。默认情况下,将使用“按概率颜色”,其中红色碱基是碱基在配对区域中彼此配对或在未配对区域中不配对的可能性最大的碱基。绿色是中间点,蓝色是最低的概率。仅当使用分区功能时,才可以按概率进行颜色设置。更改它们的设置时,“计算选项”将重新运行RNAfold,因此,根据序列的大小,可能会有明显的重新计算时间
二、3D蛋白质结构查看器
Geneious Prime 2021破解版对于分子结构文档,例如PDB文档,这将显示该结构的交互式三维视图
1、结构视图操纵
单击并拖动鼠标以旋转结构
按住Alt或Shift键,然后单击并拖动以放大/缩小
按住Ctrl键,然后右键单击并拖动以进行平移;如果使用Mac,请按住并按住Ctrl键和Alt / Option,然后拖动以进行平移
2、选择控件
结构右侧是控件,可让您控制结构的选定部分
如果您正在查看的结构包含多个模型,则可以在模型组合框中进行选择
选择按钮使您可以选择结构的全部,无选择或未选择的区域,以及按元素,组类型或辅助结构选择
突出显示选中的复选框可让您选择是否在结构视图中突出显示选定的原子
结构树以树格式显示结构中的原子。单击树中的区域以选择那些区域。您也可以按住Shift键和Ctrl键单击一次以选择多个区域
该命令框使您可以键入任意的jmol脚本命令。要查看一些示例,请在框的下拉菜单中选择一个预先填充的选项
3、显示菜单
Geneious Prime 2021破解版的查看器顶部是显示菜单。您可以在此处修改结构的外观
“重置”使您可以重置结构的位置,将结构的外观重置为默认外观,或者将结构的外观重置为其上次保存时的外观
颜色使您可以更改原子所选区域的配色方案
样式可让您将分子所选区域的样式更改为例如空格或卡通视图。
原子使您可以隐藏原子或更改分子在选定区域中的大小。您还可以选择是否显示氢原子和原子符号
键使您可以隐藏键或在分子的选定区域中更改键的大小。共价键/离子键,氢键和二硫键可分别受影响
“效果”使您可以切换整个分子的自旋,抗锯齿,立体和平板效果
保存可保存分子的当前外观
三、查看,编辑和提取注释
1、注释用于描述和可视化序列和比对中的特征,例如编码区域,限制位点和重复元件。 注释可以直接在序列查看器中的序列上注释,也可以在逻辑上分为轨道。 轨道是一个或多个注释类型的集合。 轨道垂直堆叠在所讨论的序列下方,每个轨道及其注释都有单独的一行
2、批注可能具有一个或多个与之关联的属性或限定符。 这些可以在创建注释时添加,也可以在以后通过编辑注释添加。 要查看给定注释的属性,请将鼠标放在序列查看器中。 这将显示一个工具提示,列出该批注的名称,类型,长度,间隔和顺序以及任何其他限定符,通过将鼠标悬停在注释上来显示注释属性和限定符
四、填充注释
Geneious Prime 2021破解版具有许多为序列添加注释的功能。 它们可以手动添加,从外部来源导入,从其他序列转移或作为结构或基因预测步骤的一部分添加
软件新功能
1、分析CRISPR编辑结果
轻松对齐,聚类和可视化CRISPR编辑实验中的NGS读数。通过您选择的应用程序(包括HDR,NHEJ和基础编辑器)分析变体的频率及其蛋白效应
2、增强型搜索选项
通过一个统一的界面快速访问您的文档,文件夹,分析工具和最近查看的项目
3、密码子优化和反向翻译改进
2020.2 –将鼠标悬停在优化密码子上,以获取有关同义密码子及其频率的更多信息
2020.1 –为模型生物定制密码子优化参数
2020年–全新的密码子优化算法使您可以通过从蛋白质或核苷酸序列开始生成新序列,来匹配所选生物体的密码子用法
4、分析CRISPR编辑结果的新工具
从CRISPR编辑实验的结果中比对NGS测序并使其聚类
支持各种应用程序,包括HDR,NHEJ和基本编辑器
可视化与未突变参考序列相比的变体
分析变体的频率及其蛋白效应
5、增强的搜索界面
使用文本查询从单个统一界面实时搜索文件夹和文档
搜索Geneious Prime 2021破解版中可用的分析工具(操作)的新功能
轻松访问其他高级搜索选项
快速访问最近查看的文件夹和文档
6、密码子优化改进
有关优化密码子注释的信息工具提示可在所选密码子使用表中提供有关同义密码子及其频率的信息
现在,在通过选择注释优化选择的区域时,将考虑包括方向性和CDS codon_start信息在内的注释属性
当以多个间隔优化选定注释时,跨间隔优化选择,并且允许密码子跨越相邻间隔
当优化反向选择区域时,反向互补序列现在已优化
软件亮点
1、领先的解决方案
广泛的解决方案在世界范围内使用。小型生物技术初创企业,大型制药组织,学术团体以及介于两者之间的每个人都使用Geneious优化序列数据管理,鼓励一致性和协作性并加上快速分析速度
2、生物制药药物发现
从事治疗抗体研发的企业正在选择Geneious Biologics,以快速,准确地探查大量抗体序列信息,以缩小对成功候选者的搜索范围并进行更快的创新
如何运作:Geneious Biologics与Geneious Prime 2021破解版完全相互操作。无缝的云集成使用户可以将序列数据从Geneious Biologics实时传输到,反之亦然,从而简化了用于下游处理的NGS抗体的传输
尽量减少在应用程序之间导出NGS和化验数据的需要,消除了重大的数据管理挑战,并降低了数据丢失风险。在Geneious Biologics云平台上管理的工作流是可记录和可溯源的,从而简化了整个药物返现过程中抗体NGS数据流。在云中整合抗体研究数据还可以减缓信息的可追溯性,这是保护关键IP的重要考虑因素
3、商业生命科学
在制药,诊断和农业科学等众多领域工作的组织使用软件来提高团队的效率并释放序列数据的价值
如何运作:出色的互操作性,包括API,插件开发和创建工作流的能力,意味着科学可以更快地完成。集中化程序列数据管理和分析可减少团队之间的混乱,并最大程度地提高写作的收益
提供了市场最广泛的分析工具。轻松的分子克隆应用程序是随行业趋势而更新的,并且诸如组装,比对和BLAST搜索之类的工具在一个全面的套件中都可用。用户可以迅速掌握直观设计,从而减少了训练团队所需的时间
4、学术与政府研究
学生,学者和政府专业人员可以控制他们的序列数据并发现有价值的见解。在赋予科学力量方面的声誉使其成功为世界上被引用次数最多的序列分析和管理关键
如何运行:由于其运行的全面性,在众多研究学科中扮演着不可或缺的角色。可以简单地导入或转换包括NGS在内的各种数据类型,从而是科学家可以利用新的测序技术,并最大限度地利用旧数据集的价值
系统发育学家可以使用最佳的同行评审算法来比对序列和构建树。可以在实验室工作之前设计克隆策略。可以注释基因组,并使用功能强大的工具检测变异。序列可以轻松对齐和组装
教学许多学科基础知识的绝佳工具,因为它为学习者提供了直观的接触点
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